D’un point de vue purement administratif et politique, la géographie de l’Égypte comprend une autre division importante à connaître, même si elle est moins déterminante pour votre voyage. L’État, constitué en République arabe, est divisé en 27 gouvernorats, dont les chefs (gouverneurs) sont nommés directement par le président de la République. Par ordre alphabétique, ces gouvernorats sont : Alexandrie, Assouan, Assiout, Beheira, Beni Souef, Le Caire, Dakahlia, Damiette, Fayoum, Charqiya (El-Sharquia), Guizeh, Ismaïlia, Kafr el-Cheikh, Matrouh, Minya, Menoufia, Nouvelle Vallée (El-Wadi el-Guedid), Nord-Sinaï, Port-Saïd, Qalyoubia, Qena, Mer Rouge, Gharbia, Sohag, Sud-Sinaï, Suez et Louxor.
Ces gouvernorats varient fortement en termes de superficie et de population. Les plus vastes sont, dans l’ordre, la Nouvelle Vallée, la Mer Rouge et Matrouh, qui englobent de grandes étendues désertiques. À l’inverse, les plus petits couvrent à peine le territoire d’une ville, comme Louxor, Port-Saïd ou Le Caire. Les plus peuplés sont Le Caire, Guizeh, Charqiya, Beheira et Dakahlia, tous situés dans la région centrale ou dans le delta du Nil.
Par ailleurs, comme dans de nombreux autres pays, la géographie de l’Égypte comprend également des territoires contestés, en l’occurrence avec le Soudan : le triangle de Halaïb et le triangle de Bir Tawil. Le premier est situé le long de la côte de la mer Rouge, au nord du 22e parallèle, tandis que le second se trouve à l’intérieur des terres, au sud de ce même parallèle. Le Soudan revendique la souveraineté sur le triangle de Halaïb, qui contient des gisements de pétrole exploitables, et considère que Bir Tawil relève de l’Égypte. L’interprétation de l’Égypte est inverse, et c’est finalement elle qui exerce un contrôle effectif sur le triangle de Halaïb.